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计算机建模是威利·瑞格斯RESEARCH的核心

Sherry DiBari著

威利·瑞格斯年轻时就对光学仪器着迷.

童年时收到的显微镜和望远镜的礼物使他对科学产生了热爱, 尤其是天文学和生物学.

“我开始RESEARCH外面泥坑里的水,对细菌和星星也很感兴趣,他说. “我8、9岁的时候就学会了所有的星座."

在高中时, 瑞格斯是高中天文俱乐部的活跃分子, 编辑俱乐部的杂志, “罗莎Ursina,他还带领人们参观宇宙,做关于宇宙的演讲.

“这段经历成为了我后来作为科学家和教育家的蓝图,他说.

如今,他的RESEARCH重点是分子水平上的生命.

Wriggers, 最靠谱的网赌软件机械航天工程和生物工程的弗兰克·巴顿教授, 开发3D计算机建模技术,以帮助科学家改进和重建电子显微镜(EM)图像.

箭牌曾与井和合作, ODU计算机科学系的教授, 自2015年以来. 他的贡献是对深度学习在计算环境中的应用和理解.

这项工作将“帮助生物电子显微镜跨越从原子到生物体的广泛分辨率水平。,瑞格斯说.

这些图像可以帮助科学家解释生物分子结构——由核酸和蛋白质组成的复杂组合.

“试图从原子的细节上理解这些结构有助于你理解生物机器的功能——你了解肌肉是如何在原子水平上工作的, 你知道ATP(三磷酸腺苷)是如何代谢的, (所有生物的“燃料”)驱动复杂的细胞过程,瑞格斯在最近的一篇文章中解释道 面试. “这是如何用蛋白质来完成的真的很有趣."

瑞格斯和何专攻肌动蛋白丝的建模——一种纤维, 细胞内或肌肉内的凝胶状物质,负责细胞运动和肌肉收缩.

他说:“我们是世界上仅有的五六个从事这类工作的RESEARCH人员之一。.

电子显微镜利用一束加速电子束来观察分子结构,这是传统光学显微镜无法做到的.

然而,为了不破坏样品,电子剂量必须非常低. 这将导致缺乏完整细节的低分辨率图像.

在计算机建模之前, 科学家们会手工将完整结构的模型叠加在EM图像上——这个过程既耗时又不可复制.

25年前,在计算机技术刚刚起步的时候,瑞格斯看到了一个潜在的解决方案. “我对自己说,‘为什么没有人尝试用电脑自动完成这项工作呢?'"

在回应, 瑞格公司开发了Situs, 这是一个软件包,可以将低分辨率的EM图像与计算机生成的3D模型对接. 该程序帮助填补了由于电子显微镜的缺陷而导致的缺失的工件,并改进了瑞格斯所说的“噪声”成像.

“大约25年前,它让我成名,基本上推动了我的整个学术生涯,”他说.

计算机入门

瑞格斯在德国因戈尔施塔特长大,那里是奥迪汽车公司的总部.

他的父亲和祖父都在那里工作, 和Wriggers, 像许多青少年一样, 夏天在那里工作.

这段经历让我对汽车和机械产生了终生的热爱.

在大学里,瑞格斯被物理和新兴的计算机技术所吸引.

“人们刚刚开始接触电脑, 我意识到计算机可以在物理学中发挥重要作用,他说.

In 1992, 他离开德国到伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校参加为期一年的交流项目.他笑着说:“我之所以还在这里,是因为我没有换回来。.

对于瑞格斯来说,这是一个激动人心的时刻. 物理系就在实验室研发部门的下一层楼 国家超级计算应用中心 (NCSA),他们正在开发马赛克, 第一个商用互联网浏览器, 和 洞穴虚拟现实环境.

“它真的就像宇宙的中心 贝克曼RESEARCH所 在那期间,”他说.

瑞格斯是最早将虚拟现实技术应用于3D生物结构的RESEARCH人员之一. 对于一个21岁才第一次接触电脑的人来说,这是一项创新的RESEARCH.

他的论文集中在首次模拟新发现的运动蛋白上. 这一切都是基于应用程序——其他人编写软件——这也是箭牌公司最终也会做的.

瑞格斯在加州大学做博士后时开发了Situs, 然后在同一校区的斯克里普斯RESEARCH所担任助理教授.

在ODU找到一个家

32岁时,他收到了1美元.国家卫生RESEARCH所拨款200万美元. 这笔资金确保了瑞格的工作将继续下去——从加利福尼亚到休斯顿的德克萨斯大学健康科学中心, 康奈尔大学威尔医学院,现在在俄勒冈州立大学. 补助金自2001年起连续续期.

“在最靠谱的网赌软件和工程学院,瑞格斯的工作是将工程和医学结合在一起的高质量RESEARCH的典范,伊夫特哈鲁丁汗说, 巴顿工程技术学院的临时院长. “我们珍视他作为RESEARCH者、教授和朋友的贡献."

瑞格斯离开学术界几年,参加了D.E. Shaw RESEARCH在纽约. 这个私人资助的团队在2010年实现了第一个毫秒长度的分子动力学模拟, 哪一个是生物分子建模的重大突破.

后来,当他在寻找一所大学来更新他自己的nih资助的项目和实验室时, biomachina.组织, 生活把他带到了ODU.

“当我得到这份工作的时候,我想,‘哇,他们真的很信任我,’”他说. “我真的非常感谢ODU让我能够继续我的独立RESEARCH."

瑞格斯也欢迎ODU的多学科机会,包括与 ODU赛车.

“我以前骑摩托车. 我以前开过滑翔机,”他说. “我喜欢所有会动的东西."

“来到这里,看到这栋楼里有一个活跃的赛车实验室,他说, “我真的很着迷."

作为顾问, 瑞格斯和学生们一起在汽车上安装传感器,测量车辆的参数和动态. “我们用它来提高单圈时间,更好地了解车辆的性能,”他说.

对于箭牌的下一个项目,天空是极限.

“我希望有时间回到航空航天或光学天文学项目,在那里我可以应用我们的计算工具,他说. “我认为这将是非常令人兴奋的.

“ODU的一大好处是,我可以做的事情没有任何限制."

远离校园

瑞格斯和他的妻子希拉里以及两个儿子住在弗吉尼亚海滩的奇克海滩. 这家人演奏各种乐器. 在他空闲的时候, 你可能会发现瑞格斯和他的儿子们在开放式麦克风和当地的布鲁斯果酱巡回演出,比如Froggies或Jerry's Indian River.

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